Одно и то же содержимое иногда открывается по нескольким адресам: с параметрами, с разными окончаниями, с разных разделов. Чтобы поисковик не считал это копиями, на странице указывают канонический адрес — тот, который нужно показывать в поиске.
В разделе «Неканонические страницы» перечислены страницы, которые указывают на другой адрес как на основной. В поиск они, как правило, не попадут — это нормально для дублей и фильтров каталога.
Если среди неканонических оказались важные страницы, которые должны приводить посетителей из поиска, значит, канонический адрес указан неверно. Исправьте его в настройках CMS или шаблоне страницы.